Mann-Whitney U toets - Revision history

Nan van Geloven: /* Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS? */

2018-03-13T13:53:25Z

Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS?

← Older revision		Revision as of 15:53, 13 March 2018
Line 56:		Line 56:
	* Exclude cases listwise. Cases with missing values for any variable are excluded from all analyses.		* Exclude cases listwise. Cases with missing values for any variable are excluded from all analyses.
	De eerste is de standaardinstelling en komt in de syntax te staan als " /MISSING ANALYSIS". Het betekent dat als je meerdere uitkomstvariabelen hebt die je tussen twee groepen vergelijkt met de mann-whitney, dat er voor iedere uitkomstvariabele apart gekeken wordt naar welke cases met missende waardes niet mee kunnen doen. De tweede optie "/MISSING LISTWISE" zorgt ervoor dat bij alle testen de casussen met een missende waarde in 1 van de uitkomstvariabelen niet mee doen.		De eerste is de standaardinstelling en komt in de syntax te staan als " /MISSING ANALYSIS". Het betekent dat als je meerdere uitkomstvariabelen hebt die je tussen twee groepen vergelijkt met de mann-whitney, dat er voor iedere uitkomstvariabele apart gekeken wordt naar welke cases met missende waardes niet mee kunnen doen. De tweede optie "/MISSING LISTWISE" zorgt ervoor dat bij alle testen de casussen met een missende waarde in 1 van de uitkomstvariabelen niet mee doen.

			== Welke effectmaat kan ik rapporteren als ik een Mann-Whitney U toets doe? ==

			''Het onderwerp van het onderzoek is compleetheid van de rapportage van een operatie. Ik onderscheid 5 facetten binnen rapportage. Om een indruk te geven per patiënt vat ik alle facetten samen in één score. Elke facet weegt even zwaar en een patiënt kan dus een score hebben van 0 (aan geen enkele facet voldaan) tot 5 (alle facetten zijn gerapporteerd). Nu wil ik de scores van twee onafhankelijke groepen vergelijken. De waardes zijn niet normaal verdeeld (gegeven het histogram en de Shapiro-Wilk test), dus zou ik de [[Mann-Whitney U toets]] gebruiken. Echter heb ik slecht zicht op de effectmaat (zoals ik dit wel mooi als het verschil tussen twee gemiddeldes bij een t-toets zou kunnen weergeven). Wat voor een effectmaat kan ik weergeven?

			Je zou in deze situatie de ‘Hodges-Lehmann estimate of the median difference’ kunnen rapporteren.

	== Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS?==		== Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS?==

Rebecca Holman at 06:36, 20 July 2015

2015-07-20T06:36:52Z

← Older revision		Revision as of 08:36, 20 July 2015
Line 10:		Line 10:
	Als je wilt toetsen of de waardes van een (semi-)continue variable verschillen tussen twee aparte groepen kun je de Mann-Whitney U toets gebruiken. Bijvoorbeeld als je wilt testen of het aantal behandelde lesies verschilt tussen twee armen van een studie.		Als je wilt toetsen of de waardes van een (semi-)continue variable verschillen tussen twee aparte groepen kun je de Mann-Whitney U toets gebruiken. Bijvoorbeeld als je wilt testen of het aantal behandelde lesies verschilt tussen twee armen van een studie.

	De Mann-Whitney U toets wordt vaak gebruikt als alternatief voor de [[T-toets\|ongepaarde t-toets]], omdat de Mann-Whitney geen normaal verdeelde data veronderstelt. De Mann-Whitney U toets mag altijd gebruikt worden, voor alle [[KEUZE TOETS#Van welk type is mijn uitkomstmaat?\|ordinale]] data. Als de data toch normaal verdeeld zijn, zal de Mann-Whitney iets minder [[Poweranalyse\|power]] hebben dan de [[T-toets\|ongepaarde t-toets]] om een verschil tussen de twee groepen te bemerken.		De Mann-Whitney U toets wordt vaak gebruikt als alternatief voor de [[T-toets\|ongepaarde t-toets]], omdat de Mann-Whitney geen normaal verdeelde data veronderstelt. De Mann-Whitney U toets mag altijd gebruikt worden, voor alle [[KEUZE TOETS#Van welk type is mijn uitkomstmaat?\|ordinale]] data. Als de data toch normaal verdeeld zijn, zal de Mann-Whitney iets minder [[Poweranalyse\|power]] hebben dan de [[T-toets\|ongepaarde t-toets]] om een verschil tussen de twee groepen te bemerken.

	Voorbeeld van het gebruik van de Mann-Whitney U toets:		Voorbeeld van het gebruik van de Mann-Whitney U toets:

Rebecca Holman: /* Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden? */

2015-07-16T14:44:16Z

Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden?

← Older revision		Revision as of 16:44, 16 July 2015
Line 44:		Line 44:
	==Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden?==		==Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden?==

	'' Ik heb een vraag over een discrepantie in uitslagen tussen GraphPad Prism enerzijds en SPSS statistics anderzijds. Voor de analyse van de data uit mijn pilot studie heb ik gebruik gemaakt van deze beide programma's. Zo vergeleek ik de uitkomst van mijn primaire uitkomst variabele tussen de groepen "Low risk" en "High risk". Het resultaat van de Mann Whitney volgens GraphPad is een p waarde van 0.0252, ~~PASW~~ komt met een p waarde van 0.021. Hoewel dit verschil klein is krijg ik ook voor andere variabele steeds 2 (licht) verschillende resultaten. Ik vroeg mij af of jullie mij konden helpen achterhalen waar dat verschil in zit en welk van de 2 waardes ik aan zou moeten houden.		'' Ik heb een vraag over een discrepantie in uitslagen tussen GraphPad Prism enerzijds en SPSS statistics anderzijds. Voor de analyse van de data uit mijn pilot studie heb ik gebruik gemaakt van deze beide programma's. Zo vergeleek ik de uitkomst van mijn primaire uitkomst variabele tussen de groepen "Low risk" en "High risk". Het resultaat van de Mann Whitney volgens GraphPad is een p waarde van 0.0252, SPSS komt met een p waarde van 0.021. Hoewel dit verschil klein is krijg ik ook voor andere variabele steeds 2 (licht) verschillende resultaten. Ik vroeg mij af of jullie mij konden helpen achterhalen waar dat verschil in zit en welk van de 2 waardes ik aan zou moeten houden.

	Gewoonlijk raad ik aan om de resultaten van [[statistische software#SPSS\|SPSS]] meer te vertrouwen dan die van graphpad. Zie bijvoorbeeld deze [http://www.graphpad.com/faq/viewfaq.cfm?faq=416 melding] van eedere fouten in de Mann Whitney versie van [[statistische software#Graphpad\|Graphpad]]. In dit geval echter blijkt dat na repliceren van de analyse in [[statistische software#R\|R]] dat graphpad een continuiteitscorrectie gebruikt voor het berekenen van de p-waarde en SPSS een iets ruwere p-waarde zonder correctie geeft. Niet goed of fout, maar gezien jouw relatief kleine aantallen zou ik in Graphpad uitkomst met continuiteitscorrectie gebruiken. Dit geldt voor het geval waarbij er ties (gelijke waarden) zijn en Graphpad de 'asymptotic' - en niet exact - p-waarde rapporteert.		Gewoonlijk raad ik aan om de resultaten van [[statistische software#SPSS\|SPSS]] meer te vertrouwen dan die van graphpad. Zie bijvoorbeeld deze [http://www.graphpad.com/faq/viewfaq.cfm?faq=416 melding] van eedere fouten in de Mann Whitney versie van [[statistische software#Graphpad\|Graphpad]]. In dit geval echter blijkt dat na repliceren van de analyse in [[statistische software#R\|R]] dat graphpad een continuiteitscorrectie gebruikt voor het berekenen van de p-waarde en SPSS een iets ruwere p-waarde zonder correctie geeft. Niet goed of fout, maar gezien jouw relatief kleine aantallen zou ik in Graphpad uitkomst met continuiteitscorrectie gebruiken. Dit geldt voor het geval waarbij er ties (gelijke waarden) zijn en Graphpad de 'asymptotic' - en niet exact - p-waarde rapporteert.

Rebecca Holman: /* Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden? */

2015-07-16T14:35:15Z

Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden?

← Older revision		Revision as of 16:35, 16 July 2015
Line 44:		Line 44:
	==Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden?==		==Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden?==

	'' Ik heb een vraag over een discrepantie in uitslagen tussen GraphPad Prism enerzijds en ~~PASW~~ statistics anderzijds. Voor de analyse van de data uit mijn pilot studie heb ik gebruik gemaakt van deze beide programma's. Zo vergeleek ik de uitkomst van mijn primaire uitkomst variabele tussen de groepen "Low risk" en "High risk". Het resultaat van de Mann Whitney volgens GraphPad is een p waarde van 0.0252, PASW komt met een p waarde van 0.021. Hoewel dit verschil klein is krijg ik ook voor andere variabele steeds 2 (licht) verschillende resultaten. Ik vroeg mij af of jullie mij konden helpen achterhalen waar dat verschil in zit en welk van de 2 waardes ik aan zou moeten houden.		'' Ik heb een vraag over een discrepantie in uitslagen tussen GraphPad Prism enerzijds en SPSS statistics anderzijds. Voor de analyse van de data uit mijn pilot studie heb ik gebruik gemaakt van deze beide programma's. Zo vergeleek ik de uitkomst van mijn primaire uitkomst variabele tussen de groepen "Low risk" en "High risk". Het resultaat van de Mann Whitney volgens GraphPad is een p waarde van 0.0252, PASW komt met een p waarde van 0.021. Hoewel dit verschil klein is krijg ik ook voor andere variabele steeds 2 (licht) verschillende resultaten. Ik vroeg mij af of jullie mij konden helpen achterhalen waar dat verschil in zit en welk van de 2 waardes ik aan zou moeten houden.

	Gewoonlijk raad ik aan om de resultaten van [[statistische software#SPSS\|SPSS]] meer te vertrouwen dan die van graphpad. Zie bijvoorbeeld deze [http://www.graphpad.com/faq/viewfaq.cfm?faq=416 melding] van eedere fouten in de Mann Whitney versie van [[statistische software#Graphpad\|Graphpad]]. In dit geval echter blijkt dat na repliceren van de analyse in [[statistische software#R\|R]] dat graphpad een continuiteitscorrectie gebruikt voor het berekenen van de p-waarde en SPSS een iets ruwere p-waarde zonder correctie geeft. Niet goed of fout, maar gezien jouw relatief kleine aantallen zou ik in Graphpad uitkomst met continuiteitscorrectie gebruiken. Dit geldt voor het geval waarbij er ties (gelijke waarden) zijn en Graphpad de 'asymptotic' - en niet exact - p-waarde rapporteert.		Gewoonlijk raad ik aan om de resultaten van [[statistische software#SPSS\|SPSS]] meer te vertrouwen dan die van graphpad. Zie bijvoorbeeld deze [http://www.graphpad.com/faq/viewfaq.cfm?faq=416 melding] van eedere fouten in de Mann Whitney versie van [[statistische software#Graphpad\|Graphpad]]. In dit geval echter blijkt dat na repliceren van de analyse in [[statistische software#R\|R]] dat graphpad een continuiteitscorrectie gebruikt voor het berekenen van de p-waarde en SPSS een iets ruwere p-waarde zonder correctie geeft. Niet goed of fout, maar gezien jouw relatief kleine aantallen zou ik in Graphpad uitkomst met continuiteitscorrectie gebruiken. Dit geldt voor het geval waarbij er ties (gelijke waarden) zijn en Graphpad de 'asymptotic' - en niet exact - p-waarde rapporteert.

Nan van Geloven: /* Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden? */

2014-04-14T14:36:07Z

Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden?

← Older revision		Revision as of 16:36, 14 April 2014
Line 47:		Line 47:

	Gewoonlijk raad ik aan om de resultaten van [[statistische software#SPSS\|SPSS]] meer te vertrouwen dan die van graphpad. Zie bijvoorbeeld deze [http://www.graphpad.com/faq/viewfaq.cfm?faq=416 melding] van eedere fouten in de Mann Whitney versie van [[statistische software#Graphpad\|Graphpad]]. In dit geval echter blijkt dat na repliceren van de analyse in [[statistische software#R\|R]] dat graphpad een continuiteitscorrectie gebruikt voor het berekenen van de p-waarde en SPSS een iets ruwere p-waarde zonder correctie geeft. Niet goed of fout, maar gezien jouw relatief kleine aantallen zou ik in Graphpad uitkomst met continuiteitscorrectie gebruiken. Dit geldt voor het geval waarbij er ties (gelijke waarden) zijn en Graphpad de 'asymptotic' - en niet exact - p-waarde rapporteert.		Gewoonlijk raad ik aan om de resultaten van [[statistische software#SPSS\|SPSS]] meer te vertrouwen dan die van graphpad. Zie bijvoorbeeld deze [http://www.graphpad.com/faq/viewfaq.cfm?faq=416 melding] van eedere fouten in de Mann Whitney versie van [[statistische software#Graphpad\|Graphpad]]. In dit geval echter blijkt dat na repliceren van de analyse in [[statistische software#R\|R]] dat graphpad een continuiteitscorrectie gebruikt voor het berekenen van de p-waarde en SPSS een iets ruwere p-waarde zonder correctie geeft. Niet goed of fout, maar gezien jouw relatief kleine aantallen zou ik in Graphpad uitkomst met continuiteitscorrectie gebruiken. Dit geldt voor het geval waarbij er ties (gelijke waarden) zijn en Graphpad de 'asymptotic' - en niet exact - p-waarde rapporteert.

			==Wat betekent de "missing analysis" regel die in de SPSS syntax verschijnt?==

			''Ik doe een Mann Whitney U test in SPSS (via Analyze -> Non parametric tests -> Legacy dialogs -> 2 independent samples). Na het klikken op 'Paste' verschijnt er in de syntax een regel "/MISSING ANALYSIS". Er komt wel gewoon uitput van de analyse. Wat betekent deze code?

			Je kunt bij het aansturen van de Mann-Whitney test onder 'options' kiezen voor hoe om te gaan met cases met missende waarden. SPSS biedt twee opties (uit de help file):
			* Exclude cases test-by-test. When several tests are specified, each test is evaluated separately for missing values.
			* Exclude cases listwise. Cases with missing values for any variable are excluded from all analyses.
			De eerste is de standaardinstelling en komt in de syntax te staan als " /MISSING ANALYSIS". Het betekent dat als je meerdere uitkomstvariabelen hebt die je tussen twee groepen vergelijkt met de mann-whitney, dat er voor iedere uitkomstvariabele apart gekeken wordt naar welke cases met missende waardes niet mee kunnen doen. De tweede optie "/MISSING LISTWISE" zorgt ervoor dat bij alle testen de casussen met een missende waarde in 1 van de uitkomstvariabelen niet mee doen.

	== Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS?==		== Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS?==

Nan van Geloven: /* Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS? */

2014-02-12T14:49:57Z

Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS?

← Older revision		Revision as of 16:49, 12 February 2014
Line 50:		Line 50:
	== Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS?==		== Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS?==

	Je vindt de test in SPSS 16 onder Analyze->Non-parametric Tests->2 Independent Samples.		Je vindt de test in SPSS onder Analyze->Non-parametric Tests-> (Legacy Dialogs) -> 2 Independent Samples of onder de wizard onder Analyze -> Non-parametrc Tests -> independent samples.

	== Referenties ==		== Referenties ==

Rebecca Holman at 13:37, 25 September 2013

2013-09-25T13:37:47Z

← Older revision		Revision as of 15:37, 25 September 2013
Line 56:		Line 56:
	*[http://www.tqmp.org/Content/vol04-1/p013/p013.pdf Nadim Nachar. The Mann‐Whitney U, A Test for Assessing Whether Two Independent Samples Come from the Same Distribution. Tutorials in Quantitative Methods for Psychology 2008; vol. 4(1), p. 13‐20.]		*[http://www.tqmp.org/Content/vol04-1/p013/p013.pdf Nadim Nachar. The Mann‐Whitney U, A Test for Assessing Whether Two Independent Samples Come from the Same Distribution. Tutorials in Quantitative Methods for Psychology 2008; vol. 4(1), p. 13‐20.]

	~~<div style="background-color:#e8f1ff; margin:0.5em; padding:1em; border:1px solid #C8D0DC;">~~		{{onderschrift}}
	~~Terug naar [[OVERZICHT]] voor een overzicht van alle statistische onderwerpen op deze wiki.~~

	~~Terug naar [[KEUZE TOETS]] voor hulp bij het uitzoeken van een geschikte toets of analyse.~~
	~~<div>~~

Nan van Geloven at 07:22, 28 August 2013

2013-08-28T07:22:34Z

← Older revision		Revision as of 09:22, 28 August 2013
Line 1:		Line 1:
	{{auteurs\|		{{auteurs\|
	\|mainauthor= [[user:Nan van Geloven\|ir. N. van Geloven]]		\|mainauthor= [[user:Nan van Geloven\|dr. ir. N. van Geloven]]
	\|coauthor=		\|coauthor=
	}}		}}

Nan van Geloven: /* Heb ik de juiste test gebruikt? */

2012-05-08T14:16:17Z

Heb ik de juiste test gebruikt?

← Older revision		Revision as of 16:16, 8 May 2012
Line 40:		Line 40:

	1. De n hoeft zeker niet gelijk te zijn. Bij jou komt de 10 vs 10 omdat je, onterecht, een gepaarde t-test hebt gedaan: je vergelijkt immers 2 onafhankelijke patientengroepen.		1. De n hoeft zeker niet gelijk te zijn. Bij jou komt de 10 vs 10 omdat je, onterecht, een gepaarde t-test hebt gedaan: je vergelijkt immers 2 onafhankelijke patientengroepen.
	2. Een vergelijking tussen de continue variabele bij 2 verschillende patientengroepen kan m.b.v. een independent t-test, mits de verdeling (ongeveer) normaal is en je niet te kleine aantallen hebt. Dan geef je je resultaten weer in gemiddelden en SD. Ik zie echter in je Excel-bestand 13 vs. 11 patienten, dus relatief weinig, en is de verdeling niet normaal: de mean en median waardes liggen uit elkaar. Dus kun je je resultaten het best weergeven als medianen en interkwartielbereiken (=interquartile ranges; 25-75ste percentiel) en non-parametrische statistiek gebruiken (Mann-Whitney test).		2. Een vergelijking tussen de continue variabele bij 2 verschillende patientengroepen kan m.b.v. een independent t-test, mits de verdeling (ongeveer) normaal is en je niet te kleine aantallen hebt. Dan geef je je resultaten weer in gemiddelden en SD. Ik zie echter in je Excel-bestand 13 vs. 11 patienten, dus relatief weinig, en is de verdeling niet normaal: de mean en median waardes liggen uit elkaar. Dus kun je je resultaten het best weergeven als medianen en interkwartielbereiken (=interquartile ranges; 25-75ste percentiel) en non-parametrische statistiek gebruiken (Mann-Whitney test).

			==Graphpad geeft mij een andere p-waarde voor de Mann-Whitney U toets dan SPSS, welke moet ik aanhouden?==

			'' Ik heb een vraag over een discrepantie in uitslagen tussen GraphPad Prism enerzijds en PASW statistics anderzijds. Voor de analyse van de data uit mijn pilot studie heb ik gebruik gemaakt van deze beide programma's. Zo vergeleek ik de uitkomst van mijn primaire uitkomst variabele tussen de groepen "Low risk" en "High risk". Het resultaat van de Mann Whitney volgens GraphPad is een p waarde van 0.0252, PASW komt met een p waarde van 0.021. Hoewel dit verschil klein is krijg ik ook voor andere variabele steeds 2 (licht) verschillende resultaten. Ik vroeg mij af of jullie mij konden helpen achterhalen waar dat verschil in zit en welk van de 2 waardes ik aan zou moeten houden.

			Gewoonlijk raad ik aan om de resultaten van [[statistische software#SPSS\|SPSS]] meer te vertrouwen dan die van graphpad. Zie bijvoorbeeld deze [http://www.graphpad.com/faq/viewfaq.cfm?faq=416 melding] van eedere fouten in de Mann Whitney versie van [[statistische software#Graphpad\|Graphpad]]. In dit geval echter blijkt dat na repliceren van de analyse in [[statistische software#R\|R]] dat graphpad een continuiteitscorrectie gebruikt voor het berekenen van de p-waarde en SPSS een iets ruwere p-waarde zonder correctie geeft. Niet goed of fout, maar gezien jouw relatief kleine aantallen zou ik in Graphpad uitkomst met continuiteitscorrectie gebruiken. Dit geldt voor het geval waarbij er ties (gelijke waarden) zijn en Graphpad de 'asymptotic' - en niet exact - p-waarde rapporteert.

	== Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS?==		== Waar vind ik de Mann-Whitney U toets in SPSS?==

Nan van Geloven: /* Referenties */

2011-10-26T12:00:10Z

Referenties

← Older revision		Revision as of 14:00, 26 October 2011
Line 47:		Line 47:

	== Referenties ==		== Referenties ==

			*[http://www.tqmp.org/Content/vol04-1/p013/p013.pdf Nadim Nachar. The Mann‐Whitney U, A Test for Assessing Whether Two Independent Samples Come from the Same Distribution. Tutorials in Quantitative Methods for Psychology 2008; vol. 4(1), p. 13‐20.]

	<div style="background-color:#e8f1ff; margin:0.5em; padding:1em; border:1px solid #C8D0DC;">		<div style="background-color:#e8f1ff; margin:0.5em; padding:1em; border:1px solid #C8D0DC;">